特区政府文化局表示，正安排对壁龛及铜像进行修复及清洁。因应近年极端天气频繁发生，该局将与专业文保机构研究应对方案，包括在文物保护原则下，研究在大三巴加设避雷系统的可行性，尽力降低恶劣天气对文物建筑的影响。

白莲花度假村第三季6月12日13时15分许，在特区政府地球物理气象局发出恶劣天气及雷暴警告期间，大三巴景区出现短暂电压骤降，其后管理人员在大三巴前地发现有跌落的石块。特区政府文化局迅即派员到场进行安全检查，用无人机观测和采集周边环境数据，并同特区政府消防局对大三巴立面做近距离详细检查。

结合监测数据、闭路电视资料及翻查历史记录，特区政府文化局初步认为事件是由于大三巴立面上方第二层圣像壁龛内部圣像后方位置受到雷电侧向击中所致，为有记录以来首次发生。此次雷击未对大三巴结构产生影响，壁龛内的铜像亦未受损。经仔细比对壁龛失石位置、石块风化痕迹，发现石块周围有灰泥等黏合物料，结合大三巴早年曾经历过多次修复的记录，判断落下石块有可能属于该壁龛的早期修补石料。