肖启涛指出，“碧水保卫战”同时也提高了水质，例如湖泊透明度增加等，间接增加了水体光合作用，促进水体二氧化碳的固定和消耗。“从显著的二氧化碳排放源转变成弱排放源，甚至有些湖泊正积极固定和吸收大气的二氧化碳。”

576969b“湖泊生态系统一般具有光合固碳和有机质降解排碳的双重过程，大量流域外源负荷输入等增强了湖泊水体有机质降解消耗过程，导致大量二氧化碳的产生和排放。”中国科学院南京地理与湖泊研究所博士肖启涛表示，中国开展的“碧水保卫战”显著降低了入湖负荷输入量，有效削弱了湖泊有机质降解及其排放二氧化碳的过程。

该研究集合流域特征、湖区环境、水体理化等多层属性，辨识了中国湖泊二氧化碳演变规律的物理、生物、化学驱动机制，打破中国湖泊二氧化碳动态变化研究的局限，具有重要的科学价值。