他早年曾任贵州省人民政府办公厅主任科员（正科级秘书），1998年后历任财政部办公厅部长办公室副处级秘书、财政部办公厅部长办公室正处长级秘书、财政部办公厅副司长级干部（挂职任四川省财政厅副厅长）、财政部税政司副司长、财政部税政司正司长级干部等，2013年调任湖南省财政厅党组书记、厅长。

红猫大本营点击进据湖南省纪委监委6月24日通报，湖南省人民政府办公厅一级巡视员郑建新涉嫌严重违纪违法，主动向组织交代问题，目前正接受湖南省纪委监委纪律审查和监察调查。

2022年，长沙“4·29”特别重大居民自建房倒塌事故造成54人死亡、9人受伤。事故发生后，长沙市委副书记、市长郑建新于2023年5月受到党内严重警告处分并免去现职。